為規范城鄉醫療救助資金的管理和使用，富源縣財政、民政等部門互相配合、充分發揮職能職責作用，嚴格按照“保資金安全、促民生需求、構和諧社會”要求，不斷完善城鄉醫療救助保障體系，采取三項措施，切實加強對城鄉醫療救助資金的監管。使城鄉居民“看病難、看病貴”問題得到了有效緩解、因病返貧情況逐年減少，使醫療救助政策在保障困難群眾“病有所醫”等方面發揮了重大作用。
建立資金專戶。將城鄉醫療救助資金納入社會保障資金財政專戶，建立“城鄉醫療救助資金專賬”，分賬核算、專款專用、封閉運行、嚴格按照公開、公平、公正、收支平衡的原則進行管理和使用，杜絕了克扣、截留等違紀行為的發生。
嚴格審批程序。在城鄉醫療救助資金審批過程中嚴把三關，即由鄉（鎮、街道）民政辦對救助對象家庭情況及申請材料進行初審，再由縣民政局依據有關標準對上報的救助對象進行嚴格復審，并進行救助分類，按照《富源縣社會救助聯席會議制度》進行集中審批；對由縣民政代繳的城鄉低保對象、五保對象、“參合參保”醫療救助資金，由縣財政局直接撥付到城鎮居民基本醫療保險或新型農村合作醫療基金專戶。
規范撥付流程。縣財政局業務科室根據聯合審批的城鄉醫療救助資金文件，輸入財政內網系統并經網絡傳至國庫科進行撥付。整個城鄉醫療救助資金撥付流程全部通過網絡多部門多人共同完成，既確保資金撥付的安全性、準確性，也確保了資金撥付的及時性。
2014年，共為78675人實施醫療救助，發放救助資金達1050萬元，其中：為3788名特困人員發放救助資金580萬元，為20418名城鎮居民代繳醫療保險基金143萬元，為“五保孤兒”、低保、城鄉特困對象44102戶54469人代繳年人均60元新農合參合資金327萬元。