第二批“不忘初心、牢記使命”主題教育開展以來，各省級紀檢監察機關加強對本系統第二批開展主題教育單位的指導，在鞏固深化第一批主題教育成果的同時，做好前后銜接，加強上下互動和部門聯動，引導廣大紀檢監察干部守初心、擔使命，確保主題教育取得實實在在的成效。
學習貫徹習近平新時代中國特色社會主義思想，是貫穿主題教育的主線。天津市紀委監委借鑒第一批主題教育開展廉政黨課的成功經驗，對第二批開展主題教育單位進行指導，要求突出抓好習近平新時代中國特色社會主義思想的學習，增強依規依紀依法履職的本領。市紀委監委指導開展問題查擺，基層紀檢監察機關對標中央、市委和市紀委監委的要求，檢視自身問題。市紀委監委各監督檢查室結合巡視巡察、日常監督等掌握的情況進行分析研究，提煉歸納基層紀檢監察機關共性問題，指導各單位制定具體整改方案，補齊制度短板。
浙江省紀委監委明確，對面上的共同學習任務，自上而下做好統籌規劃、一體部署，加強委機關與市縣兩級紀委監委的學習互動，及時分享第一批主題教育的學習經驗；對于主題教育整改中涉及省市縣三級的共性問題，齊心協力抓好檢視剖析，分清問題性質、責任單位，真正把問題找準找實；對表現在下面、根子在上面的問題，要做好下題上答，省紀委監委主動認領，從源頭上抓好整改。“我們將第一批、第二批單位整治工作聯動起來，第一批單位注重抓機關、帶系統、促基層，以上帶下；第二批單位對照專項整治工作要求，不等不靠、摸清底數，能動的先動起來、能改的先改起來。”該省紀委監委黨風政風監督室負責人介紹。
新疆維吾爾自治區紀委監委要求，各級紀檢監察機關和紀檢監察干部學好新時代黨的治疆方略，做好第一批與第二批的銜接推進，鞏固深化主題教育成果，確保主題教育前后銜接不割裂，力求兩批主題教育成效更實、更好、更優。要加強上級紀委監委對下級紀委監委的領導，一體推進“三不”“三項改革”“三轉”，做實做細監督職責，做到紀法雙施雙守。注重開門抓教育，特別是針對群眾最急最憂最盼的緊迫問題、基層紀檢監察機關反映的問題，省紀委監委要主動研究、及時指導、解疑釋惑，推動新時代紀檢監察工作高質量發展。
針對第二批主題教育層級下移、線長面廣的特點，省級紀檢監察機關在加強監督指導的同時還注重減輕基層負擔，嚴防層層加碼。甘肅省紀委監委為確保不增加基層負擔，借助電話通知與面上掌握兩種方式，不過度追求“留痕”，不簡單將領導批示、開會發文等作為評判標準。此外，還明確由省紀委監委黨風政風監督室具體負責督促指導，通過與干部考察、考核、課題調研等工作深度結合、同步開展，減輕基層負擔。
云南省紀委監委從嚴從實加強對各州市、縣區紀檢監察機關和省屬高校的指導，安排省紀委監委各監督檢查室、審查調查室按照聯動工作辦法，加強對本系統第二批主題教育開展情況的監督檢查，要求第二批主題教育要做到主動向第一批看齊，堅持主題不變、標準不降、力度不減，高標準嚴要求扎實推進。對于消極對待、敷衍應付的批評教育，對走形變樣、問題嚴重的嚴肅處理，確保主題教育高標準高質量開展。（毛翔 王奇）